נחל פרת הוא נחל שובה לב השוכן באזור צפון מדבר יהודה.

מקורו מאזור נווה יעקב בירושלים ונשפך בחן לבקעת הירדן, מזרחית ליריחו. הנחל משתרע על פני כ-30 ק"מ, ומקיף שטח אגן של כ-130 קמ"ר. 

מסעו לוקח אותו דרך קניונים עמוקים כשהוא חוצה את מדרגת הכפיפה העליונה של מדבר יהודה ואת חלקו הצפוני של צוק הקופיצים. 

מאפיין יוצא דופן שמייחד את נחל פרת משאר הנחלים במדבר יהודה הוא החלק התחתון שלו, העוקב אחר ציר הסינקלון הגיאולוגי. 

תופעה ייחודית זו מוסיפה לקסם ולקסם של הנחל. בעבר שימש נחל פרת כקו המפריד בין מדבר יהודה למדבר בנימין לצד נחל פרת מנקדים את הנוף מעיינות רבים ומוסיפים ליופיו הטבעי. הנחל מתהדר גם בנוכחותם של שני מנזרים פעילים ובשרידים ארכיאולוגיים מתקופות שונות. רובו של הנחל נמצא בתוך שמורת הטבע נחל פרת, אזור ייעודי בעל חשיבות אקולוגית יוצאת דופן. 

רשות הטבע והגנים מפקחת באדיקות על השמורה, כאשר פקחים מוצבים בשני מוקדים מרכזיים: עין מבוע ועין פרת. המבקרים יכולים לחקור את השמורה ולהתעמק בסביבתה הבתולית תוך הערכת ההיסטוריה העשירה והמגוון הביולוגי השופע שהיא מציעה.